בעקבות תגליות הגז הטבעי בישראל, והחשיבות הרבה שרואה משרד האנרגיה והמים בניצול הגז הטבעי להפקת תחליפי נפט ולשימושים נוספים בתעשיית הפטרוכימיה ותוספי הדלקים, הקים המשרד מינהלת לקידום תחליפי נפט מבוססי גז טבעי לתחבורה.
המנהלת הוקמה בעקבות
החלטת הממשלה 2790 לגבי "הפעלת תכנית לאומית לפיתוח טכנולוגיות המקטינות את השימוש העולמי בנפט בתחבורה ולחיזוק תעשיות עתירות ידע בתחום".